Работы Эберзина посвящены изучению моллюсков и стратиграфии кайнозоя юга СССР. Он составил стратиграфические схемы морских неогеновых отложений Закаспия, а также восточных районов Европейской части СССР. Им предложено понятие “литофация” (1940), вошедшее в мировую геологическую литературу.

Эберзин провел большие экспедиционные исследования на Мангышлаке, в Дагестане, на Кубани, в Тамани, Керчи, в районе Геленджика, Абхазии, Грузии, Украине, Молдавии и Туркмении. Награжден орденом Трудового Красного Знамени.

Некоторые из ископаемых моллюсков, описанные Эберзиным:

•  Bosphoriocracardium emarginatum (Ebersin, 1947)
•  Nagicardium nargiavagicum (Ebersin, 1947)
• Ecericardium ecerium (Ebersin, 1947)
• Limnodacna crustulata (Ebersin, 1936)
• Pachydacna (Pachydacna) duabica natella (Ebersin, 1947)

Членство в организациях и обществах

• Всесоюзное палеонтологическое общество
• Комиссия по изучению четвертичного периода
• Председатель комиссии по двустворчатым моллюскам Проблемсовета (1969—1970)
• Председатель неогеновой комиссии Межведомственного стратиграфического комитета (1957—1970).

Анатолий Георгиевич – составитель одной из крупнейших коллекций не почтовых марок, которая, по его завещанию, была передана его киевскому коллеге. Многие марки прошли через его коллекцию и оттиск его владетельного штампика встречается на многих марках.

Эберзин – автор более 150 публикаций, в том числе 9 монографий.

Основные:

– «Стратиграфия СССР. Т.12. Неоген» (в соавт., 1940)
– «Род Lininocardium Stoliczka в плиоцене Понто-Каспийского бассейна» (1947)
– «Солоноватоводные кардииды плиоцена СССР. Ч.2, 3, 4, 5» (1951, 1959, 1962, 1967) и др.

Литература об А.Г. Эберзине:

• Анатолий Георгиевич Эберзин (1904-1970) // Палеонтол. журнал. 1970. № 3. С. 100-101.
• Гончарова И.А., Гужов А.В. Малакологи Палеонтологического института РАН (двустворки, гастроподы): [А.Г. Эберзин] // Проблемы палеоэкологии и исторической геоэкологии. Сб. трудов Всерос. науч. конф., посв. памяти В.Г. Очева. М.; Саратов, 2017. С. 213-214. URL
• Горецкий Г.И., Кирсанов Н.В., Кузнецова Т.А. и др. Анатолий Георгиевич Эберзин (1904-1970) // Стратиграфия неогена Востока Европейской части СССР. М., 1971. С. 314-317.
• Ильина А.П., Луппов Н.П., Розыева Т.Р. Анатолий Георгиевич Эберзин: (1904-1970) // Изв. АН Туркм.ССР. Сер. физ.-техн. и геол. наук. 1974. № 1. С. 128.